ارائه روش های هوشمند برای شناسایی چند شکلی های تک نوکلئوتیدی کاندید

پایان نامه
چکیده

تشخیص و انتخاب الگوهای مهم موجود در بانک های اطلاعاتی، یکی از مسائل مهم در علم داده کاوی می باشد. با توجه به افزایش روزافزون داده های پزشکی و حجیم شدن بانک های اطلاعاتی، استفاده از روش های هوشمند برای دستکاری و مدیریت آنها اجتناب ناپذیر است. پیدا کردن زیرمجموعه ای از ویژگی ها (ستون های داده ای موجود در مجموعه داده ها) از یک مجموعه بزرگ، مسأله ای است که در بسیاری از زمینه ها پیش می آید. از آنجایی که افزایش تعداد ویژگی ها هزینه محاسباتی یک سیستم را افزایش می دهد، طراحی و پیاده سازی سیستم ها با کمترین تعداد ویژگی ضروری به نظر می رسد. از طرف دیگر توجه به این موضوع بسیار مهم است که زیرمجموعه موثری از ویژگی ها انتخاب شود که کارآیی قابل قبولی برای سیستم ایجاد کند. کارهای اخیر نشان می دهند که انتخاب ویژگی، می تواند تاثیر مثبتی بر روی کارآیی الگوریتم های یادگیری ماشین داشته باشد. موفقیت بسیاری از الگوریتم های یادگیری در کوشش آنها برای ساخت مدلی از داده هاست که وابسته به شناسایی مطمئن مجموعه کوچکی از ویژگی های ورودی است. دارا بودن ویژگی های نامربوط و زائد در مرحله ساخت مدل می تواند به کارآیی ضعیف و محاسبات زیاد منجر شود. در این پایان نامه قصد داریم چهار روش ترکیبی جدید را برای شناسایی snpهای (single nucleotide polymorphism) کاندید ارائه دهیم. سه روش پیشنهادی اول دارای ساختار مشابهی بوده و از دو مرحله فیلتر و بسته بندی تشکیل شده اند. در این روش ها از الگوریتم فیلتر مبتنی بر همبستگی در مرحله اول و از سه الگوریتم k-نزدیک ترین همسایه، شبکه عصبی پیشخور و رگرسیون مرزبندی، در مرحله بسته بندی استفاده شده است. روش چهارم ساختار کاملا متفاوتی داشته و براساس رابطه بین معیارهای فیلتر و بسته بندی ارائه شده است. این روش از سه مرحله ایجاد بانک اطلاعاتی، آموزش شبکه عصبی و انتخاب snpهای کاندید تشکیل شده است. نتایج بدست آمده، نشان دهنده قدرت روش های ارائه شده در مقایسه با روش های قبل می باشد.

منابع مشابه

شناسایی و بررسی خصوصیات چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

زمینه مطالعه: اینترلوکین–8، سیتوکین پیش التهابی، پروتیین کوچکی است که نقش آن جذب و فعال کردن نوتروفیل‌ها در مراحل اولیه دفاع میزبان در مقابل هجوم باکتری‌ها است. چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 می‌تواند با تأثیر بر فرآیند رونویسی این ژن، نقش و فعالیت آن را تحت تأثیر قرار دهد. هدف:  شناسایی و بررسی چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر این ژن در گاوهای بومی و هلشتاین...

متن کامل

روش های جانهی در داده های چند شکلی تک نوکلئوتیدی(snp) گم شده به صورت غیرتصادفی

هنگامی که با داده های گم شده سر و کار داریم، توجه به مکانیزم گم شدن داده ها در استنباط آماری از اهمیت زیادی برخوردار است. کنار گذاشتن داده های گم شده به خصوص در شرایطی که مکانیزم گم شدن تصادفی نباشد، موجب مخدوش شدن نتایج تحلیل خواهد شد. در حال حاضر با استفاده از تحلیل های آماری، ارتباط بین چندریختی تک-نوکلئوتیدی (snp) با برخی از بیماری ها مورد توجه بسیاری از محققین می باشد. همچنین داده های snp ...

15 صفحه اول

مطالعه چند شکلی های تک نوکلئوتیدی ناحیه مجتمع عمده پذیرش بافتی مرتبط به سیستم ایمنی در مرغ های تجاری گوشتی و تخم گذار

زمینۀ مطالعه: ناحیه  مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) مرغ‌ها در صفات تولیدی، پاسخ‌های ایمنی، مقاومت به بیماری‌های عفونی و روابط فیلوژنتیکی، دارای اهمیت زیادی است. هدف: این تحقیق به منظور بررسی چند­شکلی­های تک نوکلئوتیدی ناحیه ژنی MHC مرتبط به سیستم ایمنی در مرغ­های تجاری گوشتی و تخم­گذار انجام گرفت. روش‌کار: در این تحقیق یک‌صد نمونه خون از مرغ­های تجاری گوشتی و تخم­گذار اخذ و DNA­ی ژنوم...

متن کامل

شناسایی مولفه های رهبری هوشمند برای دانشگاهها

آموزش عالی و رهبری هوشمند آن به عنوان یکی از مهم ترین ارکان نظام آموزشی هر کشوری محسوب می شود که می تواند نقش کلیدی در تعالی جوامع داشته باشد . رهبری هوشمند یکی از رویکردهایی است که صاحب نظران حوزة مدیریت به تازگی به آن توجه کرده اند؛ بنابراین، با توجه به نظریه های رهبری در الگوهای جدید تلاش می شود تا از زاویة خلاق و هوشمند به پدیدة رهبری نگریسته شود، لذا هدف این مقاله ارائه مدل رهبری هوشمند بر...

متن کامل

شناسایی و بررسی خصوصیات چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 در گاوهای بومی و هلشتاین ایران

زمینه مطالعه: اینترلوکین–8، سیتوکین پیش التهابی، پروتیین کوچکی است که نقش آن جذب و فعال کردن نوتروفیل ها در مراحل اولیه دفاع میزبان در مقابل هجوم باکتری ها است. چند شکلی تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر ژن اینترلوکین–8 می تواند با تأثیر بر فرآیند رونویسی این ژن، نقش و فعالیت آن را تحت تأثیر قرار دهد. هدف:  شناسایی و بررسی چند شکلی های تک نوکلئوتیدی در ناحیه پروموتر این ژن در گاوهای بومی و هلشتاین...

متن کامل

مقایسه چند شکلی های تک نوکلئوتیدی جایگاه ژنی mx در سویه های مختلف مرغ

بیماری آنفلوانزای طیور یکی از بیماری های واگیر دار ویروسی موثر بر دستگاه تنفسی، گوارشی و عصبی گونه های متعدد پرندگان می باشدکه دارای قدرت انتشار سریع و از خانواده اورتومیکسوویروس ها می باشد. اینترفرون نوع 1 اولین خط دفاعی قوی و تحریک کننده قوی برای بیان پروتئین های آنتی ویروسی می باشد که اثرات حفاظتی خود را با بیان ژن mx نشان می دهند. یک جابجایی نوکلئوتیدی در جایگاه 2032، موجب تنوع پروتئین در ج...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی کرمان - دانشکده برق و کامپیوتر

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023